Le gouvernement est-il en train d’abandonner la recherche publique française ? En exigeant des économies toujours plus importantes d’un organisme déjà fragilisé par le sous-financement, le gouvernement risque de compromettre durablement ses capacités scientifiques, son attractivité et son rayonnement international.
Après les restrictions imposées aux laboratoires et le gel de recrutements contractuels, un comité de pilotage associant Bercy et le ministère de la Recherche doit encadrer sa trajectoire budgétaire. Confronté à un déficit prévisionnel de 296 millions d’euros, le CNRS est sommé d’accentuer ses économies et réduire son déficit structurel de moitié d’ici à 2027. La réforme des instituts du CNRS constitue « une mesure importante qui relève pour l’instant d’une proposition », déclarait Thierry Dauxois. Le PDG du CNRS, qui s’exprimait dans un entretien à AEF info le 16 octobre dernier, quelques mois après sa prise de fonction.
Le Centre national de la recherche scientifique (CNRS) est-il en train de perdre son autonomie budgétaire et scientifique ? C’est la crainte exprimée par le Syndicat national des travailleurs de la recherche scientifique (SNTRS-CGT), dans une déclaration présentée lors du conseil d’administration du 6 novembre 2026, consacré au deuxième budget rectificatif. La situation financière de l’établissement est particulièrement préoccupante. Selon les éléments budgétaires rapportés par le syndicat, le déficit global prévisionnel atteint 296 millions d’euros. Une situation que le SNTRS-CGT attribue moins à une mauvaise gestion qu’au sous-financement chronique de la recherche publique et à l’insuffisance de la compensation par l’État des charges qu’il impose à l’organisme.
Pour le syndicat, les ministères de tutelle font ainsi porter au CNRS la responsabilité d’un déséquilibre financier qu’ils ont largement contribué à creuser. « Il s’agit de priver les laboratoires et services de leur oxygène », dénonce-t-il, en référence aux restrictions successives imposées à l’établissement.
Des économies qui fragilisent les laboratoires et les personnels
Les premières mesures d’économies ont déjà produit leurs effets. Le SNTRS-CGT rappelle que 13,5 millions d’euros ont été prélevés sur les crédits des laboratoires dans le cadre du précédent budget rectificatif. Mais cette ponction n’a pas permis d’obtenir les économies attendues : les équipes ont continué à financer leurs activités en mobilisant leurs ressources propres disponibles, afin de maintenir leurs travaux de recherche.
Une deuxième mesure a touché les personnels contractuels. Le gel des recrutements et des prolongations de contrats à durée déterminée (CDD), hors contrats de recherche, a particulièrement affecté les personnels les plus précaires. Ces salariés assurent pourtant des missions indispensables au fonctionnement quotidien des laboratoires, souvent en compensation du manque de personnels titulaires. Ce gel a déjà provoqué des « dégâts scientifiques et humains » et la mesure doit se poursuivre jusqu’au 31 décembre, sans visibilité sur une éventuelle levée des restrictions. La direction du CNRS reconnaît elle-même, selon la déclaration syndicale, que les restrictions imposées aux laboratoires ont « mis en danger la position du CNRS ». Une situation paradoxale pour un établissement dont le rayonnement scientifique repose précisément sur la capacité de ses équipes à travailler dans la durée.
Le deuxième budget rectificatif prévoit une augmentation de 39,8 millions d’euros de la subvention pour charges de service public (SCSP). Cette enveloppe doit notamment contribuer à compenser le coût des pensions civiles (CAS pensions), à hauteur de 40 %, ainsi qu’à financer la protection sociale complémentaire des personnels. Au total, les recettes prévisionnelles progressent de 31,8 millions d’euros. Une augmentation que le SNTRS-CGT juge largement insuffisante au regard des 296 millions d’euros de déficit global annoncés.
Surtout, cette aide s’accompagne d’une nouvelle exigence : le CNRS doit ramener son déficit structurel à 76 millions d’euros en 2027, contre près de 150 millions initialement estimés. Autrement dit, l’établissement doit réduire de moitié son déficit structurel en un an. Pour le syndicat, cette trajectoire revient à imposer une austérité supplémentaire à un organisme déjà considérablement affaibli. « Quand l’austérité ne suffit plus, on impose la super-austérité », dénonce-t-il.
Le SNTRS-CGT pointe également les limites du modèle de financement reposant sur la multiplication des ressources propres et des appels à projets, notamment européens. Présentés comme une alternative à l’insuffisance des dotations publiques, ces financements sont par nature incertains et soumis à une forte concurrence entre équipes scientifiques. Ils contraignent les chercheurs à consacrer une part croissante de leur temps à la recherche de financements, au détriment de leurs activités scientifiques.
Le deuxième budget rectificatif révèle d’ailleurs une baisse de 38 millions d’euros des ressources propres par rapport au précédent budget rectificatif. Le syndicat y voit la démonstration des limites d’un système qui substitue progressivement des financements aléatoires aux dotations publiques pérennes. La baisse des financements de l’Agence nationale de la recherche (ANR) et le durcissement de la compétition européenne accentuent encore cette fragilité. La recherche publique se retrouve ainsi prise dans un cercle vicieux : les dotations récurrentes diminuent, les équipes doivent multiplier les candidatures aux appels à projets et les financements obtenus ne suffisent plus à assurer durablement le fonctionnement des laboratoires.
Un comité de surveillance sous l’autorité de Bercy ?
Dans sa note de trajectoire, le CNRS prévoit la mise en place d’un comité de pilotage associant l’établissement, le ministère de la Recherche et le ministère des Comptes publics. Officiellement, ce dispositif doit permettre de renforcer le dialogue entre l’organisme et ses tutelles et de mieux suivre sa situation financière.
Une perspective que le syndicat interprète comme une véritable mise sous surveillance. « Le CNRS accepte d’être soumis à un “comité de pilotage” », relève le SNTRS-CGT, qui redoute que cette instance ne se transforme en « comité de surveillance ». Le rapport de forces lui paraît particulièrement déséquilibré face à deux ministères, dont celui des Finances, dont la priorité est la réduction des dépenses publiques. Le syndicat s’interroge également sur les conséquences de ce dispositif pour l’indépendance de l’établissement : quelle marge de décision restera-t-il à la direction du CNRS si ses choix budgétaires sont désormais étroitement encadrés par Bercy ? Et que se passera-t-il si l’organisme ne parvient pas à respecter les objectifs financiers qui lui sont imposés ?
Pour le SNTRS-CGT, cette évolution menace directement l’autonomie du principal organisme public de recherche français. Dans sa déclaration, il dénonce également le traitement différencié réservé au CNRS et aux dispositifs de soutien public à la recherche privée. Il pointe notamment le crédit impôt recherche (CIR), dont le coût pour les finances publiques est, selon lui, proche du budget annuel du CNRS. Le syndicat ironise sur le contraste entre la surveillance financière renforcée imposée à l’organisme public et l’absence d’un contrôle comparable sur l’attribution et l’utilisation de ce dispositif fiscal.
Derrière cette comparaison, c’est bien la question des priorités budgétaires de l’État qui est posée : alors que la recherche publique est sommée de réduire ses dépenses et ses effectifs, les aides fiscales aux entreprises continuent de mobiliser des sommes considérables. Face à cette situation, le SNTRS-CGT annonce son vote contre le deuxième budget rectificatif et appelle les personnels à se mobiliser pour défendre les moyens de la recherche publique. Le syndicat réclame que les ministères de tutelle prennent leurs responsabilités et donnent au CNRS les moyens humains et financiers nécessaires à ses missions.
« Le CNRS n’a pas besoin de “pilotage” mais de moyens et des postes pour remplir sa mission scientifique », affirme-t-il. Pour les personnels, l’enjeu dépasse donc le seul équilibre comptable du CNRS : il s’agit de défendre un service public de recherche indépendant, doté de financements pérennes et de personnels en nombre suffisant.
